海南省高中畢業證的存檔管理遵循嚴格的教育部門規定，以下是畢業證存檔的具體情況：

一、學校存檔

　　紙質檔案：高中畢業證的紙質檔案由畢業學校負責管理。學校會將學生的畢業證復印件、畢業生登記表、綜合素質評價綜合信息表等材料裝入檔案袋，妥善保存。

　　電子檔案：學校還會將學生的畢業證相關信息錄入電子學籍系統，進行電子化管理。

二、教育局存檔

　　地方教育局：地方教育局作為學校學籍主管部門，會通過電子學籍系統及時核準學生學籍，并將核準后的電子學籍注冊學生名單報省教育廳備案。

　　省級教育廳：省教育廳會保留學生的電子檔案備份。

三、個人領取

　　紙質檔案領取：學生在畢業時，學校會將裝有畢業證復印件等相關材料的檔案袋交給學生本人。學生需妥善保管，嚴禁擅自啟封。

　　電子檔案查詢：學生可以通過海南省教育廳的電子學籍系統查詢自己的畢業證電子檔案。

四、特殊情況

　　學校合并或撤銷：如果學校合并，其學籍檔案移交并入的學校管理；如果學校撤銷，其學籍檔案移交教育行政主管部門指定的單位管理。

　　畢業證遺失：畢業證遺失后，學生可以向原畢業學校申請開具學歷證明書，該證明書與原畢業證具有同等法律效力。